O Programa de Pós-Graduação em Química (PGQUI) da Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia – UESB resultou da iniciativa de um grupo de professores-pesquisadores que atuam no Departamento de Ciências e Tecnologias (DCT, Campus de Jequié), Departamento de Ciências Exatas e Naturais (DCEN, Campus de Itapetinga) e Departamento de Ciências Naturais (DCN, Campus de Vitória da Conquista) que se uniram para elaborar e submeter à Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) o projeto que deu origem ao Mestrado em Química, com concentração em Química Analítica. Esse Curso foi recomendado pelo Conselho Técnico Científico da CAPES em 25 de maio de 2005, com nota 3 na avaliação da CAPES. Imediatamente após o credenciamento, o Programa iniciou as suas atividades e, após seleção, as aulas da primeira turma foram iniciadas em 16 de setembro de 2005. O Programa surgiu como uma proposta descentralizadora dos cursos de Pós-Graduação no Brasil, tradicionalmente localizados em grandes centros urbanos, estando em conformidade com a proposta de interiorização da pós-graduação Stricto Sensu. A primeira defesa do PGQUI ocorreu em 4 de abril de 2007. Desde a data de criação do PGQUI (2005) até setembro de 2021 obtiveram o título de Mestre em Química, com área de concentração em Química Analítica, 188 discentes. Desta forma, este Programa vem, desde a sua criação, contribuindo efetivamente para o desenvolvimento do ensino, pesquisa, extensão e tecnologia nas suas diferentes áreas de atuação com forte inserção no Sudoeste da Bahia.
Na avaliação trienal de 2007-2009 pela CAPES o PGQUI aumentou o conceito para 4. Na avaliação de 2010-2012 o PGQUI ficou com conceito 3. Na última avaliação, referente ao quadriênio 2013-2016, foi obtido conceito 3. A próxima avaliação está prevista para 2021, referente ao quadriênio 2017-2020.
