O Programa de Pós-Graduação em Ensino da Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia, aprovado pela Capes em 2016. Desenvolve pesquisas no campo do ensino. O Programa é destinado aos graduados em qualquer área do conhecimento e cujo projeto de pesquisa esteja voltado para a educação básica, tendo em vista que a área de concentração é Ensino na Educação Básica.

O PPGEn tem entre seus objetivos contribuir com a melhoria da formação de professores da Educação Básica e Superior, nas diferentes áreas de conhecimento, fornecendo-lhes instrumentos para a análise e para o exercício de uma prática pedagógica alicerçada em sólidos fundamentos teóricos e metodológicos, de modo a prepará-los para enfrentar os desafios relacionados à aprendizagem de conceitos específicos e de valores e atitudes necessárias à formação humana, formando pesquisadores e docentes para a educação básica e superior.