O primeiro colóquio teve como temática a produção coletiva do conhecimento dentro da constituição do Museu Pedagógico. Os II e III Colóquios debateram, respectivamente: Educação, Cultura e Patrimônio e Faces da História da Educação. O IV Colóquio versou sobre Educação, História e Cultura e o V sobre Educação: intervenção política e dimensão humana. Os VI e VII Colóquios versaram sobre: a Pesquisa do Museu Pedagógico e de suas redes de trabalho e Educação História, Memória e Práticas Sociais. O VIII Colóquio Nacional e I Internacional do Museu Pedagógico discutiram as “Redes Científicas no desenvolvimento da pesquisa”. O IX Colóquio Nacional e II Internacional tiveram como tema central “Desafios Epistemológicos das Ciências na Atualidade”. O X Colóquio Nacional e III Internacional apresentaram como temática “A produção do conhecimento no limiar do século XXI: tendências e conflitos”. O XI Colóquio Nacional e IV Internacional abordaram o tema “Crise, Conflitos e Conhecimento no Mundo Contemporâneo”. Já Colóquio atual (2017) intitula-se: XII Colóquio Nacional e V Colóquio Internacional do Museu Pedagógico “Estado, Política e Sociedade: está o mundo de ponta-cabeça?”