A Secretaria Geral de Cursos, representa pela sigla SGC, é o órgão de consulta técnica da Universidade responsável pela coordenação, orientação, supervisão, controle e registro das atividades acadêmicas discentes.
Subordinada, diretamente, à Pró-Reitoria de Graduação (PROGRAD), a SGC é composta por uma Direção Geral, no Campus de Vitória da Conquista, e por duas Subgerências Setoriais, instaladas nos Campi de Jequié e Itapetinga, cujas atividades também estão vinculadas às Pró-Reitorias de Pós-Graduação (PPG) e de Extensão (PROEX) da UESB.
Reitor: Prof. Dr. Luiz Otávio de Magalhães
Pró-Reitor de Graduação: Prof. Dr. Reginaldo Santos Pereira
Diretora Geral de Cursos: Cynthia Souza Rodrigues
Subgerente Setorial de Cursos do Campus de Jequié: Vivian Souto Miranda
Subgerente Setorial de Cursos do Campus de Itapetinga: Marta Lorena Lima Brito